По поручению президента Азербайджана, Верховного главнокомандующего Вооруженными силами Ильхама Алиева в рамках мер, осуществляемых в целях приведения азербайджанской армии в соответствие со стандартами Вооруженных сил Турции, с целью совершенствования управления в области военного образования создан Национальный университет обороны.
Существовавшие ранее Военная академия Вооруженных сил, Азербайджанская Высшая военная школа имени Гейдара Алиева и другие учебные заведения специального назначения осуществляют свою деятельность при вновь созданном Национальном университете обороны под названием Военный научно-исследовательский институт, Институт военного управления, Военный институт имени Гейдара Алиева, Учебно-образовательный центр Азербайджанской армии, Военный лицей имени Гейдара Алиева, Военный лицей имени Джамшида Нахчыванского и Военно-медицинский факультет Медицинского университета.